，审完后直接定罪并上呈御批。即使是，也无须再经过刑部、大理寺和都察院会审。这就等于赋予了锦衣卫“军事法庭”的功能。

第二，重申各省都司直接归五军都督府管辖，换句话说就是直接归兵部管，而不再受各省巡抚节制。此举进一步把地方军政和民政分开，藩司、臬司、都司三司并列的历史就此终结。

在这一点上，朱由检是绝不含糊的。他深知“枪杆子里面出政权”，军权必须完全握在自己手中！。

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